감독: 사카구치 히로노부,사카키바라 모토

오디오: 스테레오
발매일: 2001-12-17
제작사: 콜럼비아
화면비율: 1.33:1
케이스: 플라스틱

몇 차례 획기적인 과학 혁명을 통해 엄청난 발전을 이룩한 지구는 인간의 삶과 죽음을 분석하는 것까지 가능하게 된다. 그러나 어느 날 보이지 않는 적들의 공격으로 혼란을 맞는다. 정체 불명의 괴 생명체들은 지구상에 존재하는 모든 생명체로부터 에너지를 빼앗고 모든 과학시설을 파괴하며 인류의 멸종을 위한 전쟁을 벌여 나간다.
살아남은 소수의 인간은 보다 조직적인 저항을 하기 위해 첨단 장비와 강력한 무기를 가진 소규모의 레지스탕즈 'DEEP EYES'를 만들고 과거의 전쟁영웅 '그레이'를 캡틴으로 보이지 않는 적과 맞서기 시작한다.

한편, 지구에 나타난 정체불명의 생명체를 연구하던 여성 과학자 '아키'는 그 생명체들의 언어코드를 깰 수 있는 법을 밝혀 내고 지구상에 있는 어떤 힘이 어느 정도 침입자들의 행동 반경을 좁혀주고 있다는 사실을 알게되면서 그 힘의 근원을 찾아 여기저기 위험한 모험을 감행한다.
그러던 중, 위기에 몰린 '아키'는 레지스탕즈의 영웅 '그레이'와 그의 팀에게 도움을 받게되고 '아키'는 자신만이 알고 있는 힘의 비밀을 '그레이'에게 말하고 도움을 요청한다. 그녀의 끈질긴 설득에 결국 '그레이'와 그의 팀은 '아키'와 함께 힘의 근원을 찾아 모험을 떠나는데...